依據不同的用途，在Linux發行版為主的作業系統環境中，選擇適合的檔案系統(File System)一直是很多人的問題。
捨去複雜的比較，如果只講簡單重點的話：
1、桌機(Desktop PC) ，全部磁區使用EXT4檔案系統。個人習慣是/boot、/usr、/home、/var這些分別掛載分割。
2、筆電(Notebook) ，除了原本的WIndows磁區外，另外分割給Linux用的，全部磁區使用EXT4檔案系統。個人習慣是把/boot、/usr、/home切出來。
3、伺服器(Server)，除了檔案伺服器可能有搭配NTFS磁區的硬碟外，資料庫伺服器個人習慣使用XFS檔案系統，小型網站網頁伺服器則可以考慮使用EXT4與XFS並用、高階伺服器則另外有其他的考量。
4、NAND型Flash 記憶卡或隨身碟，因為是快閃記憶體，如果只在Linux環境使用，那麼用EXT2會比較好，但大多情況下是要給手機、數位相機，以及與Windows平台電腦交換檔案用，故還是以FAT為主。
5、Linux平台的智慧型手機以Android系統為主，在SD儲存空間這方面因為要和不同平台電腦搭配使用，故多半以FAT檔案系統為主，而如果要進行系統與應用程式的加速，可以切出以EXT2或EXT4檔案系統格式的磁區，專門來負責應用程式與資料的部份，提高系統I/O效率。
6、SSD固態硬碟，未來應該是使用BtrFS，不過目前在Linux環境中，還是很多人用EXT4或EXT2先擋著用。
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